De regisseur van Disney’s Atlantis: The Lost Empire onthulde plannen voor een gepland vervolg. Kirk Wise regisseerde de animatiefilm samen met Gary Trousdale als creatieve partner. Wise sprak met Collider over die voorgestelde plannen voor Atlantis 2. Er verscheen een soort van vervolg op Atlantis, namelijk de direct-to-video sequel Atlantis: Milo’s Return. Deze door Kirk besproken sequel zou een wereldwijde bioscooprelease hebben gekregen.
De film zou aanvankelijk opgevolgd gaan worden door een animatieserie getiteld Team Atlantis. Vanwege de teleurstellende opbrengst van de film werd deze serie geschrapt. In 2003 kwam Disney met Atlantis: Milo’s Return, welke bestaat uit losse verhalen gebaseerd op scenario’s geschreven voor de televisieserie.
Kirk vertelde over Atlantis 2:
“Believe it or not we did. [Story supervisor] John Sanford, Gary and I actually concocted an idea for a sequel to Atlantis. It had no relation to the Atlantis TV series that was being developed at Disney Television Animation. This was a feature-length, full-on, full-blown sequel to Atlantis.”
Wise vervolgde:
“We were going to have a new villain in the story. The villain was going to be wearing big, scary, wool, bulky, World War I-style clothing with a frightening gasmask to obscure it’s face; a little Darth Vader-esque. And this villain was going to try and retake Atlantis and finish the job that Rourke was unable to accomplish. And the big twist in the climax of the movie is that the villain is unmasked and it turns out to be Helga Sinclair. Plot twist!”
De jonge, onhandige Milo is vastbesloten het verzonken koninkrijk te vinden. Hij ontdekt een oud dagboek met aanwijzingen over de onbekende plek waar het zich zou bevinden. Samen met een groep bekwame, maar eigenwijze ontdekkingsreizigers maakt hij een avontuurlijke reis naar de bodem van de zee. Daar ontdekken ze een verloren continent vol mystieke krachten en ongelooflijke rijkdommen. Al snel verandert Milo’s missie van het vinden van Atlantis in – het redden van het volk van Atlantis.
De stemmencast bestond uit Michael J. Fox, Cree Summer, James Garner, Jacqueline Obradors, Leonard Nimoy, John Mahoney, Florence Stanley, Jim Varney, David Ogden Stiers, Jennifer Seguin.
